Por bioaumentação entende-se a aplicação de microrganismos seleccionados para incrementar a população microbiana. É o processo utilizado tanto na remediação de solos, como no tratamento de efluentes, melhorando a qualidade dos mesmos e baixando os custos operacionais, através do aumento da eficácia dos processos biológicos.

Os microrganismos são capazes de biodegradar poluentes tóxicos para a obtenção de energia (alimento), até à redução final em substâncias simples, como: dióxido de carbono, água, sais minerais e gases (metano e sulfureto). Para que este processo ocorra, o contaminante deve ser uma substância orgânica, tal como o petróleo e seus derivados, solventes halogenados e pesticidas, entre outros.

O poluente, neste caso, funciona como fonte de carbono para os microrganismos, sendo necessário o fornecimento de nutrientes como o azoto e o fósforo, bem como um agente oxidante que funcione como receptor de electrões, para além de outros nutrientes para cada contaminante específico.